商洛學(xué)院始終堅(jiān)持“科研強(qiáng)校”戰(zhàn)略，高度重視科研工作，在制度建設(shè)、項(xiàng)目建設(shè)、成果應(yīng)用轉(zhuǎn)化、科研平臺(tái)打造、服務(wù)地方社會(huì)等方面主動(dòng)作為、著力提升、不懈進(jìn)取，充分實(shí)踐了“自強(qiáng)不息 止于至善”的大學(xué)精神。
學(xué)校建成陜西省科協(xié)院士專家工作站2個(gè)（趙鵬大院士工作站、張生勇院士工作站），生物學(xué)學(xué)科進(jìn)入陜西省優(yōu)勢學(xué)科，建成全國唯一的省級(jí)尾礦資源綜合利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等18個(gè)省級(jí)研究平臺(tái)、22個(gè)市級(jí)科研平臺(tái)、10個(gè)校外博士工作站、3個(gè)農(nóng)作物技術(shù)示范推廣實(shí)驗(yàn)站，擁有全國冶金礦產(chǎn)固廢資源化匠心團(tuán)隊(duì)1個(gè)、陜西省科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)1個(gè)、陜西高校青年科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)6個(gè)，市級(jí)科研創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)10個(gè)，建有“秦嶺植物標(biāo)本陳列室”“秦嶺礦產(chǎn)資源陳列室”“商洛紅色文化資料館”3個(gè)大型科普展室，建成2個(gè)省級(jí)科普教育基地，3個(gè)市級(jí)科普基地；與浙江萬里學(xué)院、西安工業(yè)大學(xué)、西安體育學(xué)院、曲阜師范大學(xué)、西北大學(xué)、西安科技大學(xué)等6所高校簽訂了聯(lián)合培養(yǎng)碩士研究生協(xié)議，獲得研究生聯(lián)合培養(yǎng)示范工作站1個(gè)（與西北大學(xué)聯(lián)合申報(bào)）。
學(xué)校始終鼓勵(lì)廣大教師科研人員圍繞區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展開展科學(xué)研究、科技咨詢、科技服務(wù)與成果推廣，在全省高校中率先設(shè)立了“服務(wù)地方專項(xiàng)科研計(jì)劃”；建立了陜西省尾礦資源數(shù)據(jù)庫和標(biāo)本陳列室，建成全省首個(gè)中草藥標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)氣象災(zāi)害監(jiān)測預(yù)警系統(tǒng)；以“商麥5226”為代表的系列小麥新品種累計(jì)推廣540余萬畝，累計(jì)增加農(nóng)戶收入3億多元。
學(xué)校圍繞“南水北調(diào)”中線工程、商洛市移民區(qū)規(guī)劃、秦嶺生態(tài)及旅游建設(shè)等地方重大問題積極開展專題研究，向有關(guān)部門提交了以南水北調(diào)（中線）商洛水資源補(bǔ)償模型、丹江流域水土流失修復(fù)模式為代表的多種科學(xué)規(guī)劃方案和近百篇高質(zhì)量研究咨詢報(bào)告，為地方政府決策提供了諸多切實(shí)可行的理論及實(shí)踐依據(jù)，受到市委、市政府和有關(guān)部門的高度重視，為地方經(jīng)濟(jì)社會(huì)文化發(fā)展帶來了良好效益。
2006年升本以來，學(xué)校共出版學(xué)術(shù)著作、教材等130余部，被SCI、EI、CSSCI等核心期刊檢索收錄論文300余篇，授權(quán)專利195件、軟件著作權(quán)160項(xiàng)，審定植物新品種2個(gè)；學(xué)校共獲批國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、國家社科基金項(xiàng)目和國家科技推廣項(xiàng)目、教育部人文社科項(xiàng)目25項(xiàng)，省部級(jí)重大、攻關(guān)項(xiàng)目60余項(xiàng)，獲市廳級(jí)及以上級(jí)別各類科技獎(jiǎng)勵(lì)300余項(xiàng),科普類作品獲省級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)15項(xiàng)。
《商洛學(xué)院學(xué)報(bào)》學(xué)術(shù)影響不斷擴(kuò)大，兩次被評(píng)為全國高校優(yōu)秀社科學(xué)報(bào)，進(jìn)入武漢大學(xué)RCCSE核心期刊擴(kuò)展目錄和國家新聞出版廣電總署首批學(xué)術(shù)期刊認(rèn)定目錄。